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依法定傳染病分類如下：
第一類法定傳染病：
、狂犬病
、鼠疫
、嚴重急性呼吸道症候群
、天花

第二類法定傳染病：
、登革熱
、屈公病
、瘧疾
、茲卡病毒感染症
、西尼羅熱
、流行性斑疹傷寒
、腸道出血性大腸桿菌感染症
、傷寒
、副傷寒
、桿菌性痢疾
、阿米巴性痢疾
、霍亂
、急性病毒性A型肝炎
、小兒麻痺症/急性無力肢體麻痺
、炭疽病
、多重抗藥性結核病
、麻疹
、德國麻疹
、白喉
、流行性腦脊髓膜炎
、漢他病毒症候群

第三類法定傳染病：
、急性病毒性B型肝炎
、日本腦炎
、急性病毒性C型肝炎
、腸病毒感染併發重症
、急性病毒性D型肝炎
、結核病
、先天性德國麻疹症候群
、急性病毒性E型肝炎
、流行性腮腺炎
、百日咳
、侵襲性b型嗜血桿菌感染症
、退伍軍人病
、人類免疫缺乏病毒(愛滋病毒)感染
、梅毒
、先天性梅毒
、淋病
、破傷風
、新生兒破傷風
、漢生病
、急性病毒性肝炎未定型

第四類法定傳染病：
、李斯特菌症
、水痘併發症
、恙蟲病
、地方性斑疹傷寒
、發熱伴血小板減少綜合症
、萊姆病
、肉毒桿菌中毒
、庫賈氏病
、弓形蟲感染症
、布氏桿菌病
、流感併發重症
、侵襲性肺炎鏈球菌感染症
、Q熱
、類鼻疽
、鉤端螺旋體病
、兔熱病
、疱疹B病毒感染症

第五類法定傳染病：
、嚴重特殊傳染性肺炎
、新型A型流感
、黃熱病
、裂谷熱
、中東呼吸症候群冠狀病毒感染症
、拉薩熱
、馬堡病毒出血熱
、伊波拉病毒感染

其他傳染病：
、社區型MRSA
、棘狀阿米巴
、福氏內格里阿米巴腦膜腦炎
、沙門氏菌感染症
、廣東住血線蟲感染症
、肺吸蟲感染症
、細菌性腸胃炎
、病毒性腸胃炎
、旋毛蟲感染症
、肺囊蟲肺炎
、人芽囊原蟲感染
、隱球菌症
、鸚鵡熱
、疥瘡感染症
、頭蝨感染症
、亨德拉病毒感染症
、NDM-1腸道菌感染症
、貓抓病
、VISA/VRSA抗藥性檢測
、立百病毒感染症
、CRE抗藥性檢測
、常見腸道寄生蟲病
、淋巴絲蟲病
、第二型豬鏈球菌感染症
、中華肝吸蟲感染症
、肺炎黴漿菌感染症

相關查詢網址：

https://www.cdc.gov.tw/Category/DiseaseManual/bU9xd21vK0l5S3gwb3VUTldqdVNnQT09